①出力したいポリゴンの上で左クリックをし、ポリゴンを選択状態にします。
※キーボードのCtrlキーを押しながらクリックすると、ポリゴンを複数選択することも可能です。

②①で選択したポリゴンの上で右クリック→[GISへ転送]→[シェープ]をクリック

③[保存先指定]をクリックして保存先を指定します。
また、「ポリゴン」欄のファイル名も入力し、[OK]をクリックします。